2023年，杭锦旗渔业产值达7870万元，水产品总产量达到2890吨，同比增长0.24%。近年来，杭锦旗渔业工作以水产绿色健康养殖“五大行动”为抓手，创新工作举措，大力发展盐碱水域特色渔业，推广绿色高效多元化养殖模式，加快转变渔业发展方式，大力推动产业融合，取得了显著成效。

当前，杭锦旗水产总养殖面积达4.23万亩，其中池塘养殖面积达2.2万亩，湖泊面积1.7万亩，水库面积3825亩。全旗已建成标准化南美白对虾淡化培育基地3处、标粗培育基地6处，年淡化南美白对虾苗4100万尾、标粗3500万尾，成活率稳定在85%。完成池塘标准化改造4493亩，尾水处理后均能达标排放。推广稻渔综合种养1000亩，合理利用作物和水生动物之间的共生互促作用。发展螺旋藻养殖1500亩，提振经济和农渔民增收致富。

此外，杭锦旗还加强同高校、科研院所开展科技攻关，承接水产新品种、新技术、新模式开展本地化试验示范推广，引进新品种中华绒螯蟹苗220余万尾、加州鲈鱼20万尾，不断优化养殖结构，提高名特优养殖品种比重。