截至2025年6月，鄂尔多斯国际机场运营航线62条，通达国内城市：北京、杭州、天津、成都、郑州、深圳、广州、三亚、上海、太原、昆明、武汉、西安、济南、西宁、青岛、兰州、徐州、合肥、石家庄、佛山、库车、博鳌、长沙、南京、济宁、厦门、重庆、锡林浩特、阿尔山、延安、贵阳、阿拉善左旗、呼伦贝尔、连云港、福州、赤峰、通辽、乌海、二连浩特、乌兰浩特、沈阳、哈尔滨、西双版纳、桂林、临汾、呼和浩特、海口、汉中、吐鲁番、烟台、长春、银川、南昌，国际/地区城市：蒙古乌兰巴托、韩国大邱、韩国仁川、香港共计58个通航城市。

截至2025年6月，鄂尔多斯国际机场完成旅客吞吐量 1324513人次，同比减少3.4%；其中出港旅客吞吐量714137人次，同比减少0.2%，进港旅客吞吐量610376人次，同比减少6.8%；完成货邮吞吐量8263.8吨，同比增加19.7%；提供座位数1857257个，同比减少8.1%；运输飞行13399架次，同比减少5.1%；平均客座率71.3%，同比增加3.5个百分点。